Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EllO08856 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EllO08856 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EllO08856 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EllO08856 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EllO08856 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EllO08856 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EllO08856 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EllO08856 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EllO08856 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EllO08856 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EllO08856 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EllO08856 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EllO08856 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EllO08856 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EllO08856 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EllO08856 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EllO08856 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EllO08856 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EllO08856 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EllO08856 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EllO08856 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EllO08856 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EllO08856 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EllO08856 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EllO08856 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EllO08856 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EllO08856 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EllO08856 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EllO08856 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EllO08856 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EllO08856 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EllO08856 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EllO08856 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EllO08856 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EllO08856 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EllO08856 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EllO08856 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EllO08856 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EllO08856 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EllO08856 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EllO08856 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EllO08856 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EllO08856 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EllO08856 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EllO08856 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EllO08856 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EllO08856 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EllO08856 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EllO08856 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EllO08856 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EllO08856 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EllO08856 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EllO08856 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EllO08856 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EllO08856 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EllO08856 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EllO08856 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EllO08856 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EllO08856 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EllO08856 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EllO08856 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EllO08856 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EllO08856 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EllO08856 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EllO08856 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EllO08856 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EllO08856 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EllO08856 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EllO08856 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EllO08856 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EllO08856 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EllO08856 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EllO08856 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EllO08856 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EllO08856 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EllO08856 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EllO08856 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EllO08856 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EllO08856 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EllO08856 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EllO08856 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EllO08856 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EllO08856 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EllO08856 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EllO08856 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EllO08856 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EllO08856 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EllO08856 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EllO08856 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EllO08856 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EllO08856 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EllO08856 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EllO08856 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EllO08856 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EllO08856 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EllO08856 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EllO08856 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EllO08856 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EllO08856 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms