Protein–RNA interactions for Protein: O08739

Ampd3, AMP deaminase 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ampd3O08739 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ampd3O08739 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ampd3O08739 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ampd3O08739 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ampd3O08739 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ampd3O08739 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ampd3O08739 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ampd3O08739 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ampd3O08739 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ampd3O08739 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ampd3O08739 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ampd3O08739 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ampd3O08739 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ampd3O08739 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ampd3O08739 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ampd3O08739 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ampd3O08739 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ampd3O08739 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ampd3O08739 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ampd3O08739 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ampd3O08739 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ampd3O08739 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ampd3O08739 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ampd3O08739 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ampd3O08739 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ampd3O08739 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ampd3O08739 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms