Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MsmbO08540 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MsmbO08540 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsmbO08540 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsmbO08540 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsmbO08540 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MsmbO08540 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MsmbO08540 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MsmbO08540 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MsmbO08540 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MsmbO08540 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MsmbO08540 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MsmbO08540 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MsmbO08540 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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