Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm3278L7N2D2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Gm3278L7N2D2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm3278L7N2D2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm3278L7N2D2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm3278L7N2D2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm3278L7N2D2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm3278L7N2D2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm3278L7N2D2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm3278L7N2D2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm3278L7N2D2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm3278L7N2D2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm3278L7N2D2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm3278L7N2D2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm3278L7N2D2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm3278L7N2D2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm3278L7N2D2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm3278L7N2D2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm3278L7N2D2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm3278L7N2D2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm3278L7N2D2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm3278L7N2D2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm3278L7N2D2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm3278L7N2D2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm3278L7N2D2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm3278L7N2D2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm3278L7N2D2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm3278L7N2D2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm3278L7N2D2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm3278L7N2D2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm3278L7N2D2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm3278L7N2D2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm3278L7N2D2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm3278L7N2D2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm3278L7N2D2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm3278L7N2D2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm3278L7N2D2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm3278L7N2D2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm3278L7N2D2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm3278L7N2D2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm3278L7N2D2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm3278L7N2D2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm3278L7N2D2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm3278L7N2D2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm3278L7N2D2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm3278L7N2D2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3278L7N2D2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3278L7N2D2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3278L7N2D2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3278L7N2D2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3278L7N2D2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm3278L7N2D2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm3278L7N2D2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm3278L7N2D2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm3278L7N2D2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm3278L7N2D2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm3278L7N2D2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm3278L7N2D2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm3278L7N2D2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm3278L7N2D2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Gm3278L7N2D2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm3278L7N2D2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm3278L7N2D2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm3278L7N2D2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm3278L7N2D2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm3278L7N2D2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm3278L7N2D2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm3278L7N2D2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms