Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc191J3QQ27 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc191J3QQ27 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc191J3QQ27 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc191J3QQ27 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc191J3QQ27 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc191J3QQ27 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc191J3QQ27 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc191J3QQ27 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc191J3QQ27 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc191J3QQ27 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc191J3QQ27 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc191J3QQ27 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc191J3QQ27 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc191J3QQ27 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc191J3QQ27 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc191J3QQ27 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc191J3QQ27 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc191J3QQ27 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc191J3QQ27 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc191J3QQ27 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc191J3QQ27 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc191J3QQ27 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc191J3QQ27 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc191J3QQ27 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc191J3QQ27 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc191J3QQ27 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc191J3QQ27 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc191J3QQ27 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc191J3QQ27 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc191J3QQ27 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc191J3QQ27 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc191J3QQ27 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms