Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY1

Gm9242, Predicted pseudogene 9242, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9242J3QNY1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm9242J3QNY1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm9242J3QNY1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm9242J3QNY1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm9242J3QNY1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm9242J3QNY1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9242J3QNY1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms