Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm20918J3QN17 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20918J3QN17 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms