Protein–RNA interactions for Protein: G5E8S3

E230025N22Rik, Riken cDNA E230025N22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E230025N22RikG5E8S3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E230025N22RikG5E8S3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E230025N22RikG5E8S3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
E230025N22RikG5E8S3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E230025N22RikG5E8S3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E230025N22RikG5E8S3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E230025N22RikG5E8S3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E230025N22RikG5E8S3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
E230025N22RikG5E8S3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E230025N22RikG5E8S3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E230025N22RikG5E8S3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E230025N22RikG5E8S3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E230025N22RikG5E8S3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E230025N22RikG5E8S3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E230025N22RikG5E8S3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E230025N22RikG5E8S3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E230025N22RikG5E8S3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E230025N22RikG5E8S3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E230025N22RikG5E8S3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E230025N22RikG5E8S3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E230025N22RikG5E8S3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E230025N22RikG5E8S3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E230025N22RikG5E8S3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E230025N22RikG5E8S3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E230025N22RikG5E8S3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E230025N22RikG5E8S3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E230025N22RikG5E8S3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E230025N22RikG5E8S3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E230025N22RikG5E8S3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E230025N22RikG5E8S3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E230025N22RikG5E8S3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E230025N22RikG5E8S3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E230025N22RikG5E8S3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms