Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
4933406M09RikG3XA12 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
4933406M09RikG3XA12 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
4933406M09RikG3XA12 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
4933406M09RikG3XA12 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
4933406M09RikG3XA12 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4933406M09RikG3XA12 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933406M09RikG3XA12 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933406M09RikG3XA12 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933406M09RikG3XA12 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933406M09RikG3XA12 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933406M09RikG3XA12 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933406M09RikG3XA12 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933406M09RikG3XA12 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933406M09RikG3XA12 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933406M09RikG3XA12 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933406M09RikG3XA12 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
4933406M09RikG3XA12 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4933406M09RikG3XA12 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4933406M09RikG3XA12 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
4933406M09RikG3XA12 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4933406M09RikG3XA12 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4933406M09RikG3XA12 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933406M09RikG3XA12 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms