Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rnf148G3X9R7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf148G3X9R7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms