Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SprtnG3X912 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SprtnG3X912 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SprtnG3X912 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SprtnG3X912 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SprtnG3X912 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SprtnG3X912 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SprtnG3X912 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SprtnG3X912 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SprtnG3X912 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SprtnG3X912 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SprtnG3X912 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SprtnG3X912 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SprtnG3X912 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SprtnG3X912 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SprtnG3X912 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SprtnG3X912 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SprtnG3X912 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SprtnG3X912 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SprtnG3X912 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SprtnG3X912 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SprtnG3X912 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms