Protein–RNA interactions for Protein: G3UW31

Vmn1r176, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r176G3UW31 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r176G3UW31 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r176G3UW31 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r176G3UW31 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r176G3UW31 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r176G3UW31 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r176G3UW31 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r176G3UW31 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r176G3UW31 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r176G3UW31 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r176G3UW31 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r176G3UW31 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r176G3UW31 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r176G3UW31 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r176G3UW31 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r176G3UW31 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r176G3UW31 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r176G3UW31 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r176G3UW31 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r176G3UW31 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r176G3UW31 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r176G3UW31 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r176G3UW31 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r176G3UW31 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r176G3UW31 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r176G3UW31 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms