Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccl26F8VQM2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccl26F8VQM2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccl26F8VQM2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccl26F8VQM2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccl26F8VQM2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccl26F8VQM2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccl26F8VQM2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccl26F8VQM2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccl26F8VQM2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccl26F8VQM2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccl26F8VQM2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccl26F8VQM2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccl26F8VQM2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccl26F8VQM2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccl26F8VQM2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccl26F8VQM2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccl26F8VQM2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccl26F8VQM2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccl26F8VQM2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccl26F8VQM2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccl26F8VQM2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccl26F8VQM2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccl26F8VQM2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccl26F8VQM2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccl26F8VQM2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccl26F8VQM2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccl26F8VQM2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccl26F8VQM2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccl26F8VQM2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccl26F8VQM2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccl26F8VQM2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccl26F8VQM2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccl26F8VQM2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccl26F8VQM2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms