Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28038F7BCN9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28038F7BCN9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28038F7BCN9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28038F7BCN9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28038F7BCN9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28038F7BCN9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28038F7BCN9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28038F7BCN9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28038F7BCN9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28038F7BCN9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28038F7BCN9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28038F7BCN9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28038F7BCN9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28038F7BCN9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28038F7BCN9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28038F7BCN9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28038F7BCN9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28038F7BCN9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28038F7BCN9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28038F7BCN9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28038F7BCN9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28038F7BCN9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28038F7BCN9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28038F7BCN9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm28038F7BCN9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm28038F7BCN9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28038F7BCN9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm28038F7BCN9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm28038F7BCN9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28038F7BCN9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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