Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Crocc2F6XLV1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Crocc2F6XLV1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Crocc2F6XLV1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Crocc2F6XLV1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Crocc2F6XLV1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Crocc2F6XLV1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Crocc2F6XLV1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Crocc2F6XLV1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Crocc2F6XLV1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Crocc2F6XLV1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Crocc2F6XLV1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Crocc2F6XLV1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Crocc2F6XLV1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Crocc2F6XLV1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Crocc2F6XLV1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Crocc2F6XLV1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Crocc2F6XLV1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Crocc2F6XLV1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Crocc2F6XLV1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Crocc2F6XLV1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Crocc2F6XLV1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Crocc2F6XLV1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Crocc2F6XLV1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Crocc2F6XLV1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Crocc2F6XLV1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Crocc2F6XLV1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Crocc2F6XLV1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Crocc2F6XLV1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Crocc2F6XLV1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Crocc2F6XLV1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Crocc2F6XLV1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Crocc2F6XLV1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Crocc2F6XLV1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Crocc2F6XLV1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Crocc2F6XLV1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Crocc2F6XLV1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Crocc2F6XLV1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Crocc2F6XLV1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Crocc2F6XLV1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Crocc2F6XLV1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Crocc2F6XLV1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Crocc2F6XLV1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Crocc2F6XLV1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Crocc2F6XLV1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Crocc2F6XLV1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Crocc2F6XLV1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Crocc2F6XLV1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Crocc2F6XLV1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Crocc2F6XLV1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Crocc2F6XLV1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Crocc2F6XLV1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Crocc2F6XLV1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Crocc2F6XLV1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Crocc2F6XLV1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Crocc2F6XLV1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Crocc2F6XLV1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Crocc2F6XLV1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Crocc2F6XLV1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Crocc2F6XLV1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Crocc2F6XLV1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Crocc2F6XLV1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Crocc2F6XLV1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Crocc2F6XLV1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Crocc2F6XLV1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Crocc2F6XLV1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Crocc2F6XLV1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Crocc2F6XLV1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Crocc2F6XLV1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Crocc2F6XLV1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Crocc2F6XLV1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Crocc2F6XLV1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Crocc2F6XLV1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Crocc2F6XLV1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Crocc2F6XLV1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Crocc2F6XLV1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Crocc2F6XLV1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Crocc2F6XLV1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Crocc2F6XLV1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Crocc2F6XLV1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Crocc2F6XLV1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Crocc2F6XLV1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Crocc2F6XLV1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Crocc2F6XLV1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Crocc2F6XLV1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Crocc2F6XLV1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Crocc2F6XLV1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Crocc2F6XLV1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Crocc2F6XLV1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Crocc2F6XLV1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Crocc2F6XLV1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms