Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pagr1bF6V0H0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pagr1bF6V0H0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pagr1bF6V0H0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Pagr1bF6V0H0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Pagr1bF6V0H0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pagr1bF6V0H0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pagr1bF6V0H0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pagr1bF6V0H0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pagr1bF6V0H0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pagr1bF6V0H0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pagr1bF6V0H0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pagr1bF6V0H0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pagr1bF6V0H0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pagr1bF6V0H0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pagr1bF6V0H0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pagr1bF6V0H0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pagr1bF6V0H0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pagr1bF6V0H0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pagr1bF6V0H0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pagr1bF6V0H0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pagr1bF6V0H0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pagr1bF6V0H0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pagr1bF6V0H0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pagr1bF6V0H0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pagr1bF6V0H0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pagr1bF6V0H0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pagr1bF6V0H0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pagr1bF6V0H0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pagr1bF6V0H0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pagr1bF6V0H0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pagr1bF6V0H0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pagr1bF6V0H0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pagr1bF6V0H0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pagr1bF6V0H0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pagr1bF6V0H0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pagr1bF6V0H0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pagr1bF6V0H0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pagr1bF6V0H0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Pagr1bF6V0H0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pagr1bF6V0H0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pagr1bF6V0H0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pagr1bF6V0H0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pagr1bF6V0H0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pagr1bF6V0H0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms