Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28305F6U473 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28305F6U473 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms