Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmod3E9QA62 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod3E9QA62 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod3E9QA62 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod3E9QA62 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod3E9QA62 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod3E9QA62 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod3E9QA62 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod3E9QA62 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod3E9QA62 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod3E9QA62 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmod3E9QA62 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod3E9QA62 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmod3E9QA62 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms