Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga10E9Q6R1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga10E9Q6R1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga10E9Q6R1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga10E9Q6R1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga10E9Q6R1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga10E9Q6R1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga10E9Q6R1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga10E9Q6R1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga10E9Q6R1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga10E9Q6R1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga10E9Q6R1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga10E9Q6R1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga10E9Q6R1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga10E9Q6R1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga10E9Q6R1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga10E9Q6R1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga10E9Q6R1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga10E9Q6R1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga10E9Q6R1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga10E9Q6R1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga10E9Q6R1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga10E9Q6R1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga10E9Q6R1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itga10E9Q6R1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itga10E9Q6R1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itga10E9Q6R1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itga10E9Q6R1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga10E9Q6R1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms