Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CenpfE9Q3P4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpfE9Q3P4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CenpfE9Q3P4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CenpfE9Q3P4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CenpfE9Q3P4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CenpfE9Q3P4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CenpfE9Q3P4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CenpfE9Q3P4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CenpfE9Q3P4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpfE9Q3P4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpfE9Q3P4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms