Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3250E9Q1M3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3250E9Q1M3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 283.2 ms