Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt78E9Q0F0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt78E9Q0F0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt78E9Q0F0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt78E9Q0F0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt78E9Q0F0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt78E9Q0F0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt78E9Q0F0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt78E9Q0F0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt78E9Q0F0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt78E9Q0F0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt78E9Q0F0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt78E9Q0F0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt78E9Q0F0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt78E9Q0F0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt78E9Q0F0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt78E9Q0F0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt78E9Q0F0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt78E9Q0F0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt78E9Q0F0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms