Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ddx60E9PZQ1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ddx60E9PZQ1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ddx60E9PZQ1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ddx60E9PZQ1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ddx60E9PZQ1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ddx60E9PZQ1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ddx60E9PZQ1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ddx60E9PZQ1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ddx60E9PZQ1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ddx60E9PZQ1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ddx60E9PZQ1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ddx60E9PZQ1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ddx60E9PZQ1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ddx60E9PZQ1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ddx60E9PZQ1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ddx60E9PZQ1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ddx60E9PZQ1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ddx60E9PZQ1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ddx60E9PZQ1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ddx60E9PZQ1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ddx60E9PZQ1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ddx60E9PZQ1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ddx60E9PZQ1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ddx60E9PZQ1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ddx60E9PZQ1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ddx60E9PZQ1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ddx60E9PZQ1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ddx60E9PZQ1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ddx60E9PZQ1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
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Ddx60E9PZQ1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ddx60E9PZQ1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ddx60E9PZQ1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ddx60E9PZQ1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ddx60E9PZQ1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
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Ddx60E9PZQ1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ddx60E9PZQ1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ddx60E9PZQ1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ddx60E9PZQ1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ddx60E9PZQ1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ddx60E9PZQ1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ddx60E9PZQ1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
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Ddx60E9PZQ1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ddx60E9PZQ1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ddx60E9PZQ1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ddx60E9PZQ1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ddx60E9PZQ1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ddx60E9PZQ1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ddx60E9PZQ1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
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Ddx60E9PZQ1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ddx60E9PZQ1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ddx60E9PZQ1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ddx60E9PZQ1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ddx60E9PZQ1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ddx60E9PZQ1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
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Ddx60E9PZQ1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ddx60E9PZQ1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
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Ddx60E9PZQ1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
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Ddx60E9PZQ1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
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Ddx60E9PZQ1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ddx60E9PZQ1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms