Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5415E9PXF3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5415E9PXF3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5415E9PXF3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5415E9PXF3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5415E9PXF3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5415E9PXF3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5415E9PXF3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5415E9PXF3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5415E9PXF3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5415E9PXF3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5415E9PXF3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5415E9PXF3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5415E9PXF3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5415E9PXF3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5415E9PXF3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5415E9PXF3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5415E9PXF3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5415E9PXF3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5415E9PXF3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5415E9PXF3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5415E9PXF3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5415E9PXF3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5415E9PXF3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5415E9PXF3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5415E9PXF3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5415E9PXF3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5415E9PXF3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5415E9PXF3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5415E9PXF3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5415E9PXF3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5415E9PXF3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5415E9PXF3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm5415E9PXF3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5415E9PXF3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm5415E9PXF3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5415E9PXF3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5415E9PXF3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5415E9PXF3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5415E9PXF3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5415E9PXF3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5415E9PXF3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5415E9PXF3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5415E9PXF3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5415E9PXF3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5415E9PXF3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5415E9PXF3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5415E9PXF3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5415E9PXF3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms