Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp839E9PUU5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp839E9PUU5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp839E9PUU5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp839E9PUU5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp839E9PUU5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp839E9PUU5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp839E9PUU5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp839E9PUU5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp839E9PUU5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp839E9PUU5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfp839E9PUU5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfp839E9PUU5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfp839E9PUU5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfp839E9PUU5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfp839E9PUU5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp839E9PUU5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp839E9PUU5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp839E9PUU5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp839E9PUU5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp839E9PUU5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp839E9PUU5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp839E9PUU5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp839E9PUU5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp839E9PUU5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp839E9PUU5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfp839E9PUU5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfp839E9PUU5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms