Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3U4

9630041A04Rik, RIKEN cDNA 9630041A04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9630041A04RikD3Z3U4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
9630041A04RikD3Z3U4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
9630041A04RikD3Z3U4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
9630041A04RikD3Z3U4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
9630041A04RikD3Z3U4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
9630041A04RikD3Z3U4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
9630041A04RikD3Z3U4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
9630041A04RikD3Z3U4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
9630041A04RikD3Z3U4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
9630041A04RikD3Z3U4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
9630041A04RikD3Z3U4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
9630041A04RikD3Z3U4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
9630041A04RikD3Z3U4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
9630041A04RikD3Z3U4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
9630041A04RikD3Z3U4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
9630041A04RikD3Z3U4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
9630041A04RikD3Z3U4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
9630041A04RikD3Z3U4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
9630041A04RikD3Z3U4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
9630041A04RikD3Z3U4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
9630041A04RikD3Z3U4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
9630041A04RikD3Z3U4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
9630041A04RikD3Z3U4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
9630041A04RikD3Z3U4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
9630041A04RikD3Z3U4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
9630041A04RikD3Z3U4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
9630041A04RikD3Z3U4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
9630041A04RikD3Z3U4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
9630041A04RikD3Z3U4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
9630041A04RikD3Z3U4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
9630041A04RikD3Z3U4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
9630041A04RikD3Z3U4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
9630041A04RikD3Z3U4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
9630041A04RikD3Z3U4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
9630041A04RikD3Z3U4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
9630041A04RikD3Z3U4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
9630041A04RikD3Z3U4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
9630041A04RikD3Z3U4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
9630041A04RikD3Z3U4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
9630041A04RikD3Z3U4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
9630041A04RikD3Z3U4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
9630041A04RikD3Z3U4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
9630041A04RikD3Z3U4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
9630041A04RikD3Z3U4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
9630041A04RikD3Z3U4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
9630041A04RikD3Z3U4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
9630041A04RikD3Z3U4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
9630041A04RikD3Z3U4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
9630041A04RikD3Z3U4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
9630041A04RikD3Z3U4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
9630041A04RikD3Z3U4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
9630041A04RikD3Z3U4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
9630041A04RikD3Z3U4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
9630041A04RikD3Z3U4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms