Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms