Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc8D3YZV8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc8D3YZV8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms