Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC048679D3YXE9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC048679D3YXE9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC048679D3YXE9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC048679D3YXE9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC048679D3YXE9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC048679D3YXE9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC048679D3YXE9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BC048679D3YXE9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BC048679D3YXE9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms