Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3259D3YUK0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3259D3YUK0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3259D3YUK0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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