Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm20547B8JJN0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20547B8JJN0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20547B8JJN0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20547B8JJN0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20547B8JJN0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20547B8JJN0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Gm20547B8JJN0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
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Gm20547B8JJN0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Gm20547B8JJN0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Gm20547B8JJN0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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Gm20547B8JJN0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20547B8JJN0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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Gm20547B8JJN0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Gm20547B8JJN0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm20547B8JJN0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
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Gm20547B8JJN0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Gm20547B8JJN0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Gm20547B8JJN0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Gm20547B8JJN0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20547B8JJN0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20547B8JJN0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20547B8JJN0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm20547B8JJN0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20547B8JJN0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20547B8JJN0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20547B8JJN0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20547B8JJN0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20547B8JJN0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20547B8JJN0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20547B8JJN0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20547B8JJN0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20547B8JJN0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20547B8JJN0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20547B8JJN0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20547B8JJN0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Gm20547B8JJN0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20547B8JJN0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20547B8JJN0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
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Gm20547B8JJN0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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