Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apol6B7ZC55 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apol6B7ZC55 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apol6B7ZC55 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apol6B7ZC55 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apol6B7ZC55 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apol6B7ZC55 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apol6B7ZC55 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apol6B7ZC55 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Apol6B7ZC55 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Apol6B7ZC55 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apol6B7ZC55 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apol6B7ZC55 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apol6B7ZC55 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apol6B7ZC55 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apol6B7ZC55 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apol6B7ZC55 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apol6B7ZC55 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apol6B7ZC55 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apol6B7ZC55 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apol6B7ZC55 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apol6B7ZC55 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apol6B7ZC55 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apol6B7ZC55 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol6B7ZC55 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apol6B7ZC55 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apol6B7ZC55 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms