Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zscan5bB2RTN3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms