Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930402K13RikB1AW18 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
4930402K13RikB1AW18 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms