Protein–RNA interactions for Protein: B1AVH7

Tbc1d2, TBC1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2B1AVH7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbc1d2B1AVH7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbc1d2B1AVH7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbc1d2B1AVH7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbc1d2B1AVH7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbc1d2B1AVH7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d2B1AVH7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d2B1AVH7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d2B1AVH7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d2B1AVH7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d2B1AVH7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d2B1AVH7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d2B1AVH7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d2B1AVH7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d2B1AVH7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbc1d2B1AVH7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tbc1d2B1AVH7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tbc1d2B1AVH7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tbc1d2B1AVH7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.2 ms