Protein–RNA interactions for Protein: A9Q751

Cfap221, Cilia- and flagella-associated protein 221, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap221A9Q751 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap221A9Q751 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap221A9Q751 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap221A9Q751 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap221A9Q751 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap221A9Q751 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap221A9Q751 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap221A9Q751 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap221A9Q751 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap221A9Q751 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap221A9Q751 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap221A9Q751 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap221A9Q751 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap221A9Q751 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap221A9Q751 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap221A9Q751 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap221A9Q751 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Cfap221A9Q751 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap221A9Q751 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms