Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll11A4Q9F4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttll11A4Q9F4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll11A4Q9F4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms