Protein–RNA interactions for Protein: A3KMP2

Ttc38, Tetratricopeptide repeat protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc38A3KMP2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc38A3KMP2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc38A3KMP2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc38A3KMP2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc38A3KMP2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc38A3KMP2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc38A3KMP2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc38A3KMP2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc38A3KMP2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc38A3KMP2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc38A3KMP2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc38A3KMP2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc38A3KMP2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc38A3KMP2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc38A3KMP2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc38A3KMP2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc38A3KMP2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc38A3KMP2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc38A3KMP2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc38A3KMP2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc38A3KMP2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc38A3KMP2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc38A3KMP2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc38A3KMP2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc38A3KMP2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc38A3KMP2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc38A3KMP2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc38A3KMP2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc38A3KMP2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc38A3KMP2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc38A3KMP2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc38A3KMP2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc38A3KMP2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc38A3KMP2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc38A3KMP2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms