Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atp8b5A3FIN4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp8b5A3FIN4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
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