Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al1jA2BFR3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1jA2BFR3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms