Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pramef17A2ASJ1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pramef17A2ASJ1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pramef17A2ASJ1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pramef17A2ASJ1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pramef17A2ASJ1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pramef17A2ASJ1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms