Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb1A2AQ07 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tubb1A2AQ07 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb1A2AQ07 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb1A2AQ07 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb1A2AQ07 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb1A2AQ07 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb1A2AQ07 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubb1A2AQ07 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubb1A2AQ07 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubb1A2AQ07 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubb1A2AQ07 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubb1A2AQ07 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubb1A2AQ07 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubb1A2AQ07 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubb1A2AQ07 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb1A2AQ07 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb1A2AQ07 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb1A2AQ07 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb1A2AQ07 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubb1A2AQ07 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubb1A2AQ07 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubb1A2AQ07 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubb1A2AQ07 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb1A2AQ07 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb1A2AQ07 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb1A2AQ07 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb1A2AQ07 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb1A2AQ07 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb1A2AQ07 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb1A2AQ07 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms