Protein–RNA interactions for Protein: A2ALW2

Zkscan16, Zinc finger with KRAB and SCAN domains 16, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan16A2ALW2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zkscan16A2ALW2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zkscan16A2ALW2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zkscan16A2ALW2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zkscan16A2ALW2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zkscan16A2ALW2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zkscan16A2ALW2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zkscan16A2ALW2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zkscan16A2ALW2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zkscan16A2ALW2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zkscan16A2ALW2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zkscan16A2ALW2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zkscan16A2ALW2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Zkscan16A2ALW2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zkscan16A2ALW2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zkscan16A2ALW2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zkscan16A2ALW2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zkscan16A2ALW2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zkscan16A2ALW2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Zkscan16A2ALW2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zkscan16A2ALW2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zkscan16A2ALW2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Zkscan16A2ALW2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zkscan16A2ALW2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zkscan16A2ALW2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zkscan16A2ALW2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zkscan16A2ALW2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zkscan16A2ALW2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Zkscan16A2ALW2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zkscan16A2ALW2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zkscan16A2ALW2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zkscan16A2ALW2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zkscan16A2ALW2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zkscan16A2ALW2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zkscan16A2ALW2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zkscan16A2ALW2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zkscan16A2ALW2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zkscan16A2ALW2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zkscan16A2ALW2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zkscan16A2ALW2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zkscan16A2ALW2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zkscan16A2ALW2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zkscan16A2ALW2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zkscan16A2ALW2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zkscan16A2ALW2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zkscan16A2ALW2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zkscan16A2ALW2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zkscan16A2ALW2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zkscan16A2ALW2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zkscan16A2ALW2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Zkscan16A2ALW2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zkscan16A2ALW2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zkscan16A2ALW2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms