Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700023F06RikA2AB62 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700023F06RikA2AB62 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700023F06RikA2AB62 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700023F06RikA2AB62 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700023F06RikA2AB62 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700023F06RikA2AB62 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700023F06RikA2AB62 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700023F06RikA2AB62 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700023F06RikA2AB62 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700023F06RikA2AB62 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
1700023F06RikA2AB62 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700023F06RikA2AB62 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700023F06RikA2AB62 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700023F06RikA2AB62 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700023F06RikA2AB62 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700023F06RikA2AB62 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700023F06RikA2AB62 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700023F06RikA2AB62 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700023F06RikA2AB62 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
1700023F06RikA2AB62 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700023F06RikA2AB62 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700023F06RikA2AB62 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700023F06RikA2AB62 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700023F06RikA2AB62 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms