Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C87977A2A958 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C87977A2A958 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C87977A2A958 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C87977A2A958 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C87977A2A958 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C87977A2A958 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C87977A2A958 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C87977A2A958 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C87977A2A958 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C87977A2A958 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C87977A2A958 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C87977A2A958 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C87977A2A958 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C87977A2A958 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C87977A2A958 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C87977A2A958 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C87977A2A958 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C87977A2A958 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C87977A2A958 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C87977A2A958 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C87977A2A958 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C87977A2A958 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C87977A2A958 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C87977A2A958 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C87977A2A958 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C87977A2A958 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C87977A2A958 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C87977A2A958 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C87977A2A958 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C87977A2A958 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C87977A2A958 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C87977A2A958 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C87977A2A958 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C87977A2A958 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C87977A2A958 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C87977A2A958 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C87977A2A958 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C87977A2A958 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C87977A2A958 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C87977A2A958 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C87977A2A958 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C87977A2A958 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C87977A2A958 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C87977A2A958 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C87977A2A958 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C87977A2A958 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C87977A2A958 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C87977A2A958 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C87977A2A958 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C87977A2A958 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C87977A2A958 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C87977A2A958 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C87977A2A958 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C87977A2A958 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C87977A2A958 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C87977A2A958 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C87977A2A958 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C87977A2A958 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C87977A2A958 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C87977A2A958 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C87977A2A958 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C87977A2A958 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C87977A2A958 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C87977A2A958 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C87977A2A958 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C87977A2A958 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms