Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chd5A2A8L1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chd5A2A8L1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd5A2A8L1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd5A2A8L1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd5A2A8L1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd5A2A8L1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd5A2A8L1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd5A2A8L1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd5A2A8L1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd5A2A8L1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd5A2A8L1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd5A2A8L1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd5A2A8L1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd5A2A8L1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd5A2A8L1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd5A2A8L1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd5A2A8L1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd5A2A8L1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd5A2A8L1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd5A2A8L1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd5A2A8L1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd5A2A8L1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd5A2A8L1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chd5A2A8L1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chd5A2A8L1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chd5A2A8L1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms