Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Calcoco2A2A6M5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms