Protein–RNA interactions for Protein: A2A6C4

Sppl2c, Signal peptide peptidase-like 2C, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2cA2A6C4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sppl2cA2A6C4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sppl2cA2A6C4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sppl2cA2A6C4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sppl2cA2A6C4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sppl2cA2A6C4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sppl2cA2A6C4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sppl2cA2A6C4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sppl2cA2A6C4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sppl2cA2A6C4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sppl2cA2A6C4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sppl2cA2A6C4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sppl2cA2A6C4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sppl2cA2A6C4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sppl2cA2A6C4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sppl2cA2A6C4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sppl2cA2A6C4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sppl2cA2A6C4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sppl2cA2A6C4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sppl2cA2A6C4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Sppl2cA2A6C4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sppl2cA2A6C4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sppl2cA2A6C4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sppl2cA2A6C4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sppl2cA2A6C4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Sppl2cA2A6C4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sppl2cA2A6C4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sppl2cA2A6C4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Sppl2cA2A6C4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sppl2cA2A6C4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sppl2cA2A6C4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sppl2cA2A6C4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sppl2cA2A6C4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sppl2cA2A6C4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sppl2cA2A6C4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sppl2cA2A6C4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sppl2cA2A6C4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sppl2cA2A6C4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sppl2cA2A6C4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sppl2cA2A6C4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sppl2cA2A6C4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sppl2cA2A6C4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sppl2cA2A6C4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sppl2cA2A6C4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sppl2cA2A6C4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sppl2cA2A6C4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms