Protein–RNA interactions for Protein: A2A3V1

Akap17b, A-kinase anchor protein 17B, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap17bA2A3V1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Akap17bA2A3V1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Akap17bA2A3V1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Akap17bA2A3V1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Akap17bA2A3V1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Akap17bA2A3V1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Akap17bA2A3V1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Akap17bA2A3V1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Akap17bA2A3V1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Akap17bA2A3V1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Akap17bA2A3V1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Akap17bA2A3V1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Akap17bA2A3V1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Akap17bA2A3V1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Akap17bA2A3V1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Akap17bA2A3V1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Akap17bA2A3V1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Akap17bA2A3V1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Akap17bA2A3V1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Akap17bA2A3V1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Akap17bA2A3V1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Akap17bA2A3V1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Akap17bA2A3V1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Akap17bA2A3V1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Akap17bA2A3V1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Akap17bA2A3V1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Akap17bA2A3V1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Akap17bA2A3V1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Akap17bA2A3V1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Akap17bA2A3V1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Akap17bA2A3V1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms