Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIX9

Cfap99, Cilia and flagella-associated protein 99, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap99A0A140LIX9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfap99A0A140LIX9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
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